Bydd Mr Cryan yn gadael ar ddiwedd y mis hwn, cyhoeddodd Deutsche Bank neithiwr ar ôl cyfarfod o'i fwrdd goruchwylio yn Frankfurt. Mae Mr Gwnïo wedi dod yn brif weithredwr ar unwaith.
Dywedodd y Cadeirydd, Paul Achleitner, fod y bwrdd wedi penderfynu rhannu'r cwmni gyda Mr Cryan ar ôl dim ond tair blynedd yn dilyn "dadansoddiad cynhwysfawr" a ddaeth i'r casgliad "mae arnom angen gweithredu deinamig newydd wrth arwain ein banc".
Ychwanegodd Mr Achleitner: "Er gwaethaf ei ddaliadaeth gymharol fyr fel prif weithredwr, mae John Cryan wedi chwarae rhan hollbwysig yn hanes bron 150 o Deutsche Bank - a gosododd y gwaith ar gyfer dyfodol llwyddiannus y banc.